山东科学 ›› 2023, Vol. 36 ›› Issue (2): 23-32.doi: 10.3976/j.issn.1002-4026.2023.02.004
刘文文(), 高云云, 尹志鹏, 吕刚, 王玉, 赵英会()
收稿日期:
2021-12-29
出版日期:
2023-04-20
发布日期:
2023-04-11
通信作者:
*赵英会(1971—),女,教授,硕士研究生导师,研究方向为致癌致畸病原体感染与检测。Tel:13605383576,E-mail:yhzhao@sdfmu.edu.cn
E-mail:17686147352@163.com;yhzhao@sdfmu.edu.cn
作者简介:
刘文文(1996—),女,硕士研究生,研究方向为致癌致畸病原体感染与检测。Tel:18815380582,E-mail:17686147352@163.com
基金资助:
LIU Wenwen(), GAO Yunyun, YIN Zhipeng, LÜ Gang, WANG Yu, ZHAO Yinghui()
Received:
2021-12-29
Online:
2023-04-20
Published:
2023-04-11
摘要:
运用网络药理学和分子对接方法探索黄连温胆汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎的分子机制。应用中药系统药理学数据库与分析平台对黄连温胆汤药物活性成分及药物作用靶点基因进行筛选。通过Genecards 数据库、DisGENET数据库查找幽门螺杆菌相关性胃炎疾病相关靶点,利用维恩在线绘图工具获得疾病与药物的共同靶点基因。利用Cytoscape 3.8.2软件以及STRING数据库分别构建药物-化合物-靶点相互作用网络及蛋白质-蛋白质相互作用网络图。运用DAVID数据库进行基因本体功能和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。选取度值排名前3的靶点蛋白和活性成分使用AutoDockTools 1.5.6软件进行分子对接。共筛选得到槲皮素、川皮苷、柚皮素等127种黄连温胆汤药物活性成分,并获得Akt1、JUN、TNF-α、STAT3等101个潜在靶点蛋白,涉及P53信号通路、NOD样受体信号通路、TNF信号通路等90条信号通路。分子对接结果显示关键靶点STAT3、TP53、Akt1与活性成分槲皮素、川皮苷、柚皮素的亲和力较好,其中以Akt1与柚皮素的结合能力最强。通过分析黄连温胆汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎的作用靶点和相关信号通路,能够为临床应用和后续实验研究提供理论基础。
中图分类号:
刘文文, 高云云, 尹志鹏, 吕刚, 王玉, 赵英会. 基于网络药理学和分子对接探讨黄连温胆汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎的作用机制[J]. 山东科学, 2023, 36(2): 23-32.
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表1
药物共有活性成分"
药物 | MOL ID | 共同活性成分 | OB/% | DL |
---|---|---|---|---|
黄连-甘草 | MOL000098 | 槲皮苷(quercetin) | 46.43 | 0.28 |
半夏-生姜 | MOL000449 | 豆甾醇(stigmasterol) | 43.83 | 0.76 |
半夏-生姜 | MOL000358 | β-谷甾醇 (beta-sitosterol) | 36.91 | 0.75 |
陈皮-枳实 | MOL005828 | 川皮苷(nobiletin) | 61.67 | 0.52 |
陈皮-枳实 | MOL005100 | 5,7-二羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基苯基)-色满-4-酮 | 47.74 | 0.27 |
陈皮-枳实-甘草 | MOL004328 | 柚皮素(naringenin) | 59.29 | 0.21 |
陈皮-甘草 | MOL000359 | 谷甾醇(sitosterol) | 36.91 | 0.75 |
表2
药物-活性成分-靶点网络中度值排名前8的活性成分的性质及来源"
药物 | 活性成分 | MOL ID | 度值 |
---|---|---|---|
黄连-甘草 | 槲皮素(quercetin) | MOL000098 | 133 |
陈皮-枳实 | 川皮苷(nobiletin) | MOL005828 | 39 |
陈皮-枳实-甘草 | 柚皮素(naringenin) | MOL004328 | 37 |
甘草 | 毛蕊异黄酮(calycosin) | MOL000417 | 31 |
半夏-生姜 | β-谷甾醇(beta-sitosterol) | MOL000358 | 27 |
半夏 | 黄芩素(baicalein) | MOL002714 | 18 |
甘草 | 槲皮素衍生物(quercetin der) | MOL004961 | 16 |
枳实 | 四甲氧基乌托林(tetramethoxyluteolin) | MOL007879 | 38 |
表3
药物活性成分-靶点-疾病网络中度值高于均值的靶点基因"
蛋白名称 | 基因名称 | 度值 |
---|---|---|
前列腺素G/H合酶2 | PTGS2 | 121 |
热休克蛋白90α | HSP90AA1 | 86 |
雄激素受体 | AR | 84 |
诱导型一氧化氮合酶 | NOS2 | 78 |
过氧化物酶体增殖物激活受体 | PPARG | 75 |
前列腺素G/H合酶1 | PTGS1 | 71 |
糖原合成酶激酶3β | GSK3B | 58 |
丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶Chk1 | CHEK1 | 51 |
丝裂原活化蛋白激酶14 | MAPK14 | 47 |
凝血酶原 | F2 | 43 |
内皮型一氧化氮合酶 | NOS3 | 23 |
毒蕈碱乙酰胆碱受体M3 | CHRM3 | 16 |
孕酮受体 | PGR | 13 |
凋亡调节因子Bcl-2 | BCL2 | 12 |
溶质载体家族6 | SLC6A4 | 11 |
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